学校1958年建校，校址设置在锦州市医院（现锦州市中心医院），市卫生局局长兼任学校校长。

1959年3月，市卫生局将学校移交锦州市医院，学校改名为锦州市医院附属卫校，校长由市医院院长兼任。

1960年11月，学校与市中医进修学院合并，改名为锦州市卫生学校。

1961年12月，锦州市原区属卫校、市医院处所办中药班、市卫生局所办中医带徒班并入锦州市卫生学校。

1977年2月，学校迁至凌河区北京路四段26号校址，隶属于锦州市卫生局。

1978年4月，学校升格为正县级单位。

2000年9月，锦州市卫生学校隶属关系由原卫生局移交市教委。

2001年12月，原锦州北湖中学并入锦州市卫生学校。

2004年，原锦州市化工医药职高并入锦州市卫生学校。

2005年，学校晋升为国家级重点中等职业学校。

2007年，市教育局进行教育资源整合，将原锦州市第六中学校园划拨给锦州市卫生学校使用。学校北京路四段36号校区，由学校和第二、三职专共同使用。

2014年11月，原北京路校区、市委党校校区、太和六中校区进行整合，搬迁至滨海新区天山路15号锦州市职教园区。